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Riepilogo del corso

Traduzione assistita da IA - scopri di più e suggerisci miglioramenti

Congratulazioni per aver completato il corso di formazione Scale with Seqera! 🎉

Il vostro percorso

Avete iniziato registrandovi su Seqera Platform ed esplorando il Community Showcase, poi avete lanciato una pipeline di scala produttiva, nf-core/rnaseq, dall'interfaccia web e monitorato la sua esecuzione. Successivamente, avete autenticato il CLI tw e imparato a fare tutto dal terminale. Infine, avete registrato una nuova pipeline, nf-core/demo, da GitHub e l'avete lanciata sia dall'interfaccia web che dal CLI.

Cosa avete imparato

Siete ora in grado di lanciare e monitorare pipeline Nextflow su Seqera Platform, sia che preferiate l'interfaccia web che la riga di comando.

  • Un account Seqera gratuito vi offre uno spazio di lavoro personale e l'accesso al Community Showcase.
  • Le pipeline aggiunte a uno spazio di lavoro appaiono nel Launchpad e possono essere lanciate con pochi clic.
  • Il CLI tw offre le stesse funzionalità dell'interfaccia web, utile per la creazione di script e l'automazione.
  • Qualsiasi pipeline ospitata su GitHub con un main.nf e un nextflow.config può essere registrata con tw pipelines add.
  • tw launch accetta i parametri tramite profili e --params-file, anziché tramite flag individuali.

Competenze acquisite

Attraverso questo corso pratico, avete imparato a:

  • Registrarsi su Seqera Platform ed esplorare il Community Showcase
  • Aggiungere una pipeline a uno spazio di lavoro e lanciare un'esecuzione dall'interfaccia web
  • Monitorare l'esecuzione e ispezionare i dettagli e i report a livello di attività
  • Autenticare e utilizzare il CLI tw per gestire e lanciare pipeline dal terminale
  • Registrare una pipeline ospitata su GitHub e lanciarla con un file di parametri

Siete ora pronti per eseguire e monitorare le vostre pipeline su Seqera Platform, su larga scala.

Prossimi passi per sviluppare le vostre competenze

Ecco i nostri principali suggerimenti su cosa fare dopo:

Ottenere aiuto

Per risorse di supporto e assistenza dalla community, consultate la pagina di aiuto.

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