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1. Formation Nextflow

Bienvenue sur le portail de formation de la communauté Nextflow !

Ces supports de formation sont libres et gratuits pour tout le monde. Ils sont hébergés dans un repositoire GitHub avec des scripts d'exemple et une configuration de développement.

Bien que vous puissiez suivre le matériel à tout moment, vous en tirerez probablement le meilleur parti en participant à un événement de formation organisé. Des événements gratuits en ligne sont organisés régulièrement avec la communauté nf-core, voir la page des événements nf-core pour en savoir plus.

Ouvrez dans Gitpod

1.1 Ateliers disponibles

Plusieurs ateliers sont disponibles sur ce site. Trouvez celui qui vous convient le mieux :

Atelier de formation de base Nextflow

Il s'agit du principal matériel de formation Nextflow utilisé dans la plupart des formations Nextflow et nf-core.

Formation de base pour tout ce qui concerne Nextflow. Parfaite pour toute personne souhaitant se familiariser avec l'utilisation de Nextflow pour effectuer des analyses et construire des workflows.

Démarrer l'atelier de formation Nextflow

Formation pratique

Ce cours est assez court et pratique, idéal si vous souhaitez mettre en pratique vos compétences Nextflow.

Un didacticiel "learn by doing" qui met moins l'accent sur la théorie et propose plutôt des exercices d'une complexité croissante.

Lancer la formation pratique

1.2 Resources

Référence rapide de quelques liens utiles :

Reference  Communité
Documents Nextflow Slack Nextflow  
Page d'accueil de Nextflow nf-core
Seqera Seqera Community

Vous ne savez pas où aller ? Consultez la page Obtenir de l'aide.

1.3 Crédits et contributions

Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0

Tous les documents de formation ont été rédigés à l'origine par Seqera mais il a été mis en libre accès (CC BY-NC-ND) pour la communauté.

Les corrections et améliorations apportées par la communauté sont les bienvenues. Chaque page a un l'icône en haut à droite de la page, qui vous conduira à GitHub où vous pourrez éditer le matériel source de la formation par le biais d'une pull-request.

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