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Résumé du cours

Traduction assistée par IA - en savoir plus et suggérer des améliorations

Félicitations pour avoir terminé le cours de formation Configure Execution ! 🎉

Votre parcours

Vous avez commencé par adapter l'exécution d'un pipeline à différents environnements de calcul : en changeant de technologie de packaging logiciel et en sélectionnant une plateforme d'exécution. Ensuite, vous avez appris à contrôler les allocations de ressources et à relancer automatiquement les tâches qui échouent. Enfin, vous avez appris à regrouper la configuration en profils, à les combiner au moment de l'exécution et à inspecter la configuration entièrement résolue.

Compétences acquises

Au cours de cette formation pratique, vous avez appris à :

  • Passer d'une technologie de packaging logiciel à une autre entre Docker et Conda
  • Sélectionner une plateforme d'exécution et comprendre ce qui change en coulisses lorsque vous le faites
  • Contrôler les allocations de ressources par processus et relancer automatiquement les tâches qui échouent
  • Définir et combiner des profils, et inspecter la configuration résolue avec nextflow config

Vous êtes désormais équipé·e pour configurer des pipelines Nextflow pour une variété d'environnements de calcul en toute confiance.

Prochaines étapes pour développer vos compétences

Voici nos meilleures suggestions pour la suite :

  • Apprenez à exécuter des pipelines de la communauté nf-core avec Use nf-core
  • Lancez et surveillez des pipelines à grande échelle avec Scale with Seqera
  • N'exécutez pas seulement Nextflow, écrivez-le ! Devenez un·e développeur·se Nextflow avec Hello Nextflow
  • Appliquez Nextflow à un cas d'usage d'analyse scientifique avec Nextflow for Science

Obtenir de l'aide

Pour les ressources d'aide et le soutien de la communauté, consultez la page d'aide.

Enquête de satisfaction

Avant de continuer, veuillez prendre un moment pour compléter l'enquête du cours ! Vos retours nous aident à améliorer nos supports de formation pour tout le monde.

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