Résumé du cours¶

Traduction assistée par IA - en savoir plus et suggérer des améliorations

Félicitations pour avoir terminé le cours de formation Scale with Seqera ! 🎉

Votre parcours¶

Vous avez commencé par vous inscrire sur Seqera Platform et explorer la Community Showcase, puis vous avez lancé un pipeline à l'échelle de la production, nf-core/rnaseq, depuis l'interface web et surveillé son exécution. Ensuite, vous avez authentifié le CLI tw et appris à tout faire depuis le terminal. Enfin, vous avez enregistré un nouveau pipeline, nf-core/demo, depuis GitHub et l'avez lancé à la fois depuis l'interface web et le CLI.

Ce que vous avez appris¶

Vous êtes maintenant en mesure de lancer et de surveiller des pipelines Nextflow sur Seqera Platform, que vous préfériez l'interface web ou la ligne de commande.

Un compte Seqera gratuit vous donne accès à un espace de travail personnel et à la Community Showcase.
Les pipelines ajoutés à un espace de travail apparaissent dans le Launchpad et peuvent être lancés en quelques clics.
Le CLI tw offre les mêmes fonctionnalités que l'interface web, ce qui est utile pour les scripts et l'automatisation.
Tout pipeline hébergé sur GitHub avec un fichier main.nf et un fichier nextflow.config peut être enregistré avec tw pipelines add.
tw launch prend en charge les paramètres via des profils et --params-file, plutôt que des options individuelles.

Compétences acquises¶

Au cours de cette formation pratique, vous avez appris à :

Vous inscrire sur Seqera Platform et explorer la Community Showcase
Ajouter un pipeline à un espace de travail et lancer une exécution depuis l'interface web
Surveiller l'exécution et inspecter les détails et les rapports au niveau des tâches
Authentifier et utiliser le CLI tw pour gérer et lancer des pipelines depuis le terminal
Enregistrer un pipeline hébergé sur GitHub et le lancer avec un fichier de paramètres

Vous êtes désormais équipé·e pour exécuter et surveiller vos propres pipelines sur Seqera Platform, à grande échelle.

Prochaines étapes pour développer vos compétences¶

Voici nos meilleures suggestions pour la suite :

Ne vous contentez pas d'exécuter des pipelines, développez-en ! Apprenez à écrire les vôtres avec Hello Nextflow ou Build with nf-core
Appliquez Nextflow à un cas d'usage d'analyse scientifique avec Nextflow for Science
Explorez des fonctionnalités Nextflow plus avancées avec les Quêtes secondaires

Obtenir de l'aide¶

Pour les ressources d'aide et le support de la communauté, consultez la page d'aide.

Enquête de satisfaction¶

Avant de continuer, prenez un moment pour répondre à l'enquête du cours ! Vos retours nous aident à améliorer nos supports de formation pour tout le monde.

Répondre à l'enquête