Resumo do curso¶

Tradução assistida por IA - saiba mais e sugira melhorias

Parabéns por concluir o curso de treinamento Scale with Seqera! 🎉

Sua jornada¶

Você começou criando uma conta na Seqera Platform e explorando o Community Showcase, depois lançou um pipeline em escala de produção, nf-core/rnaseq, pela interface web e monitorou sua execução. Em seguida, você autenticou o CLI tw e aprendeu a fazer tudo pelo terminal. Por fim, você registrou um novo pipeline, nf-core/demo, a partir do GitHub e o lançou tanto pela interface web quanto pelo CLI.

O que você aprendeu¶

Agora você é capaz de lançar e monitorar pipelines Nextflow na Seqera Platform, seja pela interface web ou pela linha de comando.

Uma conta gratuita na Seqera dá acesso a um workspace pessoal e ao Community Showcase.
Pipelines adicionados a um workspace aparecem no Launchpad e podem ser lançados com poucos cliques.
O CLI tw oferece as mesmas funcionalidades que a interface web, sendo útil para scripts e automação.
Qualquer pipeline hospedado no GitHub com um main.nf e nextflow.config pode ser registrado com tw pipelines add.
O tw launch recebe parâmetros por meio de profiles e --params-file, em vez de flags individuais.

Habilidades adquiridas¶

Ao longo deste curso prático, você aprendeu a:

Criar uma conta na Seqera Platform e explorar o Community Showcase
Adicionar um pipeline a um workspace e lançar uma execução pela interface web
Monitorar a execução e inspecionar detalhes e relatórios no nível de tarefa
Autenticar e usar o CLI tw para gerenciar e lançar pipelines pelo terminal
Registrar um pipeline hospedado no GitHub e lançá-lo com um arquivo de parâmetros

Agora você está pronto para executar e monitorar seus próprios pipelines na Seqera Platform, em escala.

Próximos passos para desenvolver suas habilidades¶

Aqui estão nossas principais sugestões para o que fazer a seguir:

Não apenas execute pipelines, desenvolva-os! Aprenda a escrever os seus próprios com Hello Nextflow ou Build with nf-core
Aplique o Nextflow a um caso de uso de análise científica com Nextflow for Science
Explore recursos mais avançados do Nextflow com os Side Quests

Obtendo ajuda¶

Para recursos de ajuda e suporte da comunidade, consulte a página de Ajuda.

Pesquisa de feedback¶

Antes de continuar, reserve um minuto para responder à pesquisa do curso! Seu feedback nos ajuda a melhorar nossos materiais de treinamento para todos.

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