Treinamento Nextflow¶
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Cursos de autoatendimento
Bem-vindo ao portal de treinamento da comunidade Nextflow!
Os cursos de treinamento listados abaixo foram desenvolvidos para serem utilizados como um recurso de autoatendimento. Você pode realizá-los por conta própria a qualquer momento, seja no ambiente baseado na web que disponibilizamos via Github Codespaces ou no seu próprio ambiente.
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Informações adicionais
Compatibilidade de versões
A partir de janeiro de 2026, todos os nossos cursos de treinamento Nextflow exigem a versão 25.10.2 ou posterior do Nextflow, com sintaxe estrita ativada, salvo indicação em contrário.
Para mais informações sobre os requisitos de versão e sintaxe estrita, consulte o guia de migração da documentação do Nextflow.
Versões mais antigas do material de treinamento correspondentes à sintaxe anterior estão disponíveis através do seletor de versão na barra de menu desta página.
Opções de ambiente
Disponibilizamos um ambiente de treinamento baseado na web onde tudo o que você precisa para realizar o treinamento já está pré-instalado, disponível através do Github Codespaces (requer uma conta gratuita no GitHub).
Se isso não atender às suas necessidades, consulte as outras opções de ambiente.
Eventos de treinamento
Se você preferir realizar o treinamento Nextflow como parte de um evento estruturado, há muitas oportunidades para isso. Recomendamos verificar as seguintes opções:
- Training Weeks organizadas trimestralmente pela equipe da Comunidade
- Seqera Events incluem eventos de treinamento presenciais organizados pela Seqera (pesquise por 'Seqera Sessions' e 'Nextflow Summit')
- Nextflow Ambassadors organizam eventos para suas comunidades locais
- nf-core events incluem hackathons da comunidade
Informações para instrutores
Se você é um instrutor que conduz seus próprios treinamentos, é bem-vindo a utilizar nossos materiais diretamente do portal de treinamento, desde que atribua os devidos créditos. Consulte 'Créditos e contribuições' abaixo para mais detalhes.
Além disso, adoraríamos ouvir de você sobre como poderíamos apoiar melhor seus esforços de treinamento! Entre em contato conosco em community@seqera.io ou no fórum da comunidade (consulte a página de Ajuda).
Licença de código aberto e política de contribuição
Este material de treinamento é desenvolvido e mantido pela Seqera e disponibilizado sob uma licença de código aberto (CC BY-NC-SA) em benefício da comunidade. Se você deseja utilizar este material de uma forma que esteja fora do escopo da licença (observe as limitações sobre uso comercial e redistribuição), entre em contato conosco em community@seqera.io para discutir sua solicitação.
Agradecemos melhorias, correções e relatórios de bugs da comunidade. Cada página possui um ícone no canto superior direito que leva ao repositório de código, onde você pode reportar problemas ou propor alterações ao material de treinamento via pull request. Consulte o
README.mdno repositório para mais detalhes.
Tradução assistida por IA
Esta tradução foi criada utilizando inteligência artificial e revisada por tradutores humanos. Agradecemos seu feedback e sugestões de melhorias. Consulte nosso guia de tradução para mais informações.
Catálogo de cursos de treinamento Nextflow¶
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Trilha introdutória
Nextflow para Iniciantes¶
Cursos independentes de domínio destinados a quem é completamente novo no Nextflow. Cada curso consiste em uma série de módulos de treinamento projetados para ajudar os participantes a desenvolver suas habilidades progressivamente.
Hello Nextflow: Aprenda a desenvolver seus próprios pipelines
Este curso aborda os componentes principais da linguagem Nextflow com detalhes suficientes para permitir o desenvolvimento de pipelines simples, mas totalmente funcionais, além de elementos-chave de design, desenvolvimento e práticas de configuração de pipelines.
Nextflow Run: Aprenda a executar pipelines existentes
Uma introdução concisa à execução e configuração de pipelines Nextflow, baseada no curso para desenvolvedores Hello Nextflow, mas com menos foco em código. Aborda execução, saídas, estrutura básica de código e configuração para diferentes ambientes de computação.
Nextflow para Ciência¶
Aprenda a aplicar os conceitos e componentes apresentados no 'Hello Nextflow' a casos de uso científicos específicos.
Nextflow para Genômica (chamada de variantes)
Para pesquisadores que desejam aprender a desenvolver seus próprios pipelines de genômica. O curso utiliza um caso de uso de chamada de variantes para demonstrar como desenvolver um pipeline de genômica simples, mas funcional.
Nextflow para RNAseq (RNAseq em massa)
Para pesquisadores que desejam aprender a desenvolver seus próprios pipelines de RNAseq. O curso utiliza um caso de uso de processamento de RNAseq em massa para demonstrar como desenvolver um pipeline de RNAseq simples, mas funcional.
Nextflow para Imagem (omics espacial)
Para pesquisadores em imagem e omics espacial que desejam aprender a executar e personalizar pipelines de análise. O curso utiliza o pipeline nf-core/molkart para fornecer um pipeline biologicamente relevante e demonstrar como executar, configurar e gerenciar entradas para fluxos de trabalho de pipelines Nextflow.
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Trilha avançada
De Nextflow para nf-core¶
Aprenda a utilizar código e boas práticas do projeto comunitário nf-core.
Esses cursos ajudam você a ir dos fundamentos do Nextflow às boas práticas do nf-core. Entenda como e por que a comunidade nf-core desenvolve pipelines, e como você pode contribuir e reutilizar essas técnicas.
Hello nf-core: Comece com o nf-core
Para desenvolvedores que desejam aprender a executar e desenvolver pipelines compatíveis com o nf-core. O curso aborda a estrutura dos pipelines nf-core com detalhes suficientes para permitir o desenvolvimento de pipelines simples, mas totalmente funcionais, que seguem o template e as boas práticas de desenvolvimento do nf-core, além de utilizar módulos nf-core existentes.
Treinamento Avançado em Nextflow¶
Aprenda conceitos e mecanismos avançados para desenvolver e implantar pipelines Nextflow para atender a casos de uso do mundo real.
Side Quests: Mergulhos profundos em tópicos independentes
Mini-cursos independentes destinados a desenvolvedores Nextflow que desejam ampliar seu repertório e/ou aprofundar suas habilidades em tópicos específicos. São apresentados de forma linear, mas podem ser realizados em qualquer ordem (consulte as dependências na visão geral de cada mini-curso).
Training Collections: Trilhas de aprendizado recomendadas pelos Side Quests
As Training Collections combinam múltiplos Side Quests para oferecer uma experiência de aprendizado abrangente em torno de um tema ou caso de uso específico.
Procurando materiais de treinamento arquivados?
Materiais de treinamento mais antigos (Treinamento Fundamental, Treinamento Avançado e outros cursos experimentais) foram removidos do portal de treinamento por serem incompatíveis com a sintaxe estrita do Nextflow 3.0. Se você precisar acessar esses materiais, eles estão disponíveis no histórico do git anterior a janeiro de 2026.
