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Nextflow 교육

  • 자기 주도 학습 과정

    Nextflow 커뮤니티 교육 포털에 오신 것을 환영합니다!

    아래 과정을 자신의 속도에 맞춰 진행하세요. 웹 기반 환경 또는 개인 환경에서 학습할 수 있습니다. 각 과정은 실습 중심으로 구성되어 있으며, 목표 지향적인 연습 문제를 독립적으로 완료할 수 있습니다.

    과정 살펴보기

  • 교육 이벤트

    자기 주도 학습 이상의 것을 찾고 계신가요?

    구조화된 교육 이벤트, 자체 교육 운영을 위한 가이드, 오픈 소스 라이선스 및 기여 정책을 확인하세요.

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AI 지원 번역

이 번역은 인공지능을 사용하여 생성되었으며 사람 번역자가 검토했습니다. 피드백과 개선 제안을 환영합니다. 자세한 내용은 번역 가이드를 참조하세요.

Nextflow 교육 과정 카탈로그

  • 사용자를 위한 과정

    파이프라인 실행

    코드 작성 없이 기존 파이프라인을 실행하는 방법을 학습합니다.

    Nextflow Run: Nextflow로 파이프라인 실행하기

    코드 이해 없이 Nextflow 파이프라인을 실행하는 방법을 빠르게 학습합니다. 파이프라인 실행, 출력 결과 가져오기, 컨테이너 사용, 기본 수준의 실행 설정을 다룹니다.

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    Use nf-core: 커뮤니티 큐레이션 파이프라인 찾기 및 실행하기

    nf-core 커뮤니티 프로젝트에서 파이프라인을 찾고, 실행하고, 설정하는 방법을 빠르게 학습합니다. 최소한의 데모 파이프라인부터 시작하여 프로덕션 규모의 분석 파이프라인까지 단계적으로 확장합니다.

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    Scale with Seqera: 대규모 파이프라인 실행 및 모니터링

    웹 인터페이스와 명령줄 모두에서 Seqera Platform을 사용하여 Nextflow 파이프라인을 실행하고 모니터링하는 방법을 실습합니다.

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    실행 관리

    파이프라인 실행을 효과적으로 관리하는 방법을 학습합니다.

    Configure Execution: 리소스, 재시도, 실행 프로파일 설정하기

    Nextflow 파이프라인 실행 설정을 실습합니다. 다양한 컴퓨팅 환경에 적응하고, 리소스 할당 및 재시도를 제어하며, 사전 설정된 설정 프로파일 간에 전환하는 방법을 다룹니다.

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    추가 주제 예정

    성능 튜닝, HPC/클라우드 실행 등이 이 섹션에 추가될 예정입니다. 다음에 다룰 주제에 대해 간단한 관심 설문에서 투표해 주세요.

  • 개발자를 위한 과정

    파이프라인 작성

    나만의 Nextflow 파이프라인을 개발하는 방법을 학습합니다.

    Hello Nextflow: 처음부터 나만의 파이프라인 개발하기

    이 과정은 간단하지만 완전히 기능하는 파이프라인을 개발할 수 있을 만큼 Nextflow 언어의 핵심 구성 요소를 충분히 다룹니다. 파이프라인 설계, 개발 및 설정 방법의 핵심 요소도 포함됩니다.

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    Build with nf-core: nf-core 도구 및 규칙 활용하기

    nf-core 호환 파이프라인을 개발하고자 하는 Nextflow 개발자를 위한 과정입니다. nf-core 파이프라인의 구조를 충분히 다루어 nf-core 템플릿과 개발 모범 사례를 활용하고 기존 nf-core 모듈을 사용하는 간단하지만 완전히 기능하는 파이프라인을 개발할 수 있도록 합니다.

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    Side Quests: 고급 Nextflow 주제 살펴보기

    Nextflow 개발자가 특정 주제에 대한 역량을 넓히거나 심화하고자 할 때 활용할 수 있는 단독 실행형 단기 과정 모음입니다. 순서대로 제시되어 있지만 어떤 순서로든 수강할 수 있습니다(각 단기 과정 개요의 의존성 참조).

    Side Quests 살펴보기

    과학 연구를 위한 Nextflow

    특정 과학 응용 분야를 위한 Nextflow 파이프라인 개발 방법을 학습합니다.

    Genomics: 변이 호출 파이프라인 개발하기

    자체 유전체학 파이프라인을 개발하고자 하는 연구자를 위한 과정입니다. 변이 호출 사례를 활용하여 필수 Nextflow 개발 패턴을 학습합니다.

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    RNAseq: 벌크 RNAseq 처리 파이프라인 개발하기

    자체 RNAseq 파이프라인을 개발하고자 하는 연구자를 위한 과정입니다. 벌크 RNAseq 처리 사례를 활용하여 필수 Nextflow 개발 패턴을 학습합니다.

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    Bioimaging: 이미징 파이프라인 실행 및 설정하기

    바이오이미징 파이프라인을 실행하고 설정하는 방법을 학습하고자 하는 연구자를 위한 과정입니다. nf-core/molkart를 활용하여 필수 Nextflow 사용 패턴을 학습합니다.

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설정 및 도움말

  • 교육 환경

    Nextflow 교육을 위한 환경 설정 옵션을 안내합니다.

    교육 환경 보기

  • Nextflow 버전

    Nextflow 문법 버전의 변화를 이해하고 관리하는 방법을 안내합니다.

    버전 요구사항 확인

  • Hello 파이프라인

    Hello 파이프라인의 기능과 구조에 대한 요약을 확인합니다.

    요약 읽기

  • 도움말

    Nextflow 교육 중 문제가 발생했을 때 활용할 수 있는 유용한 자료를 안내합니다.

    도움말 찾기