Side Questscourse¶
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Resumen del curso
Traducción asistida por IA - más información y sugerencias
Las Side Quests son mini-cursos de entrenamiento independientes que profundizan en temas específicos de Nextflow.
Cada Side Quest puede tomarse de forma independiente, en cualquier orden, según sus intereses y necesidades.
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Información adicional
Requisitos técnicos
Necesitarás una cuenta de GitHub O una instalación local de Nextflow. Consulta Opciones de entorno para más detalles.
Objetivos de aprendizaje
- Configurar un entorno de desarrollo de Nextflow productivo
- Aplicar patrones avanzados de scripting para transformaciones de datos complejas
- Manejar y propagar metadatos a través de workflows de múltiples pasos
- Dividir y agrupar canales de datos para procesamiento paralelo y serial
- Probar workflows de Nextflow usando nf-test
- Componer pipelines complejos a partir de módulos de workflow reutilizables con nombre
- Trabajar eficientemente con archivos usando las operaciones de archivos de Nextflow
- Depurar problemas comunes de workflows de forma sistemática
- Usar y crear plugins de Nextflow
Audiencia y prerrequisitos
- Audiencia: Esta colección está diseñada para personas que han completado el curso para principiantes Hello Nextflow y desean profundizar en temas específicos.
- Habilidades: Se asume experiencia con la línea de comandos y familiaridad con los conceptos y herramientas básicas de Nextflow.
- Cursos: Debe haber completado Hello Nextflow o equivalente.
Descripción general del curso¶
Si esta es la primera vez que explora las Side Quests, comience con la página de Orientación para obtener una descripción general del entorno de entrenamiento y los materiales.
Side Quests¶
| Side Quest | Resumen | Tiempo Estimado |
|---|---|---|
| Entorno de Desarrollo | Configure un entorno de desarrollo local de Nextflow productivo | 45 mins |
| Patrones Esenciales de Scripting | Técnicas avanzadas de scripting para desafíos comunes en workflows | 90 mins |
| Procesamiento de Archivos de Entrada | Manejo de archivos, operaciones de rutas y organización de salidas | 45 mins |
| Metadatos y Meta Maps | Uso de mapas de metadatos para rastrear y propagar información de muestras | 45 mins |
| División y Agrupación | Técnicas para dividir y reagrupar canales de datos | 45 mins |
| Pruebas con nf-test | Escritura y ejecución de pruebas para workflows de Nextflow | 1 hora |
| Depuración de Workflows | Identificación y corrección de errores comunes en workflows | 1 hora |
| Workflows de Workflows | Composición de pipelines complejos a partir de módulos de workflow reutilizables | 30 mins |
| Desarrollo de Plugins | Uso y creación de plugins de Nextflow | 3 horas |
Háganos saber qué otros temas le gustaría ver cubiertos aquí publicando en la sección de Training del foro de la comunidad.