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Bem vindo ao treinamento básico do Nextflow

Estamos entusiasmados em tê-lo no caminho para escrever fluxos de trabalho científicos reprodutíveis e escaláveis usando o Nextflow. Este guia complementa a documentação oficial do Nextflow - se você tiver alguma dúvida, acesse a documentação oficial localizada aqui.

Ao final deste curso você deverá:

1. Ser proficiente em escrever pipelines com o Nextflow
2. Conhecer os conceitos básicos de Canais, Processos e Operadores no Nextflow
3. Ter uma compreensão dos fluxos de trabalho usando contêineres
4. Entender as diferentes plataformas de execução suportadas pelo Nextflow
5. Sentir-se apresentado à comunidade e ecossistema do Nextflow

Visão geral

Para começar a usar o Nextflow o mais rápido possível, seguiremos as seguintes etapas:

1. Configurar um ambiente de desenvolvimento para executar o Nextflow
2. Explorar os conceitos do Nextflow usando alguns fluxos de trabalho básicos, incluindo uma análise de RNA-Seq com várias etapas
3. Criar e usar contêineres do Docker para encapsular todas as dependências do fluxo de trabalho
4. Mergulhar mais fundo na sintaxe principal do Nextflow, incluindo Canais, Processos e Operadores
5. Cobrir cenários de implantação na nuvem e em clusters e explorar os recursos do Nextflow Tower

Isso lhe dará uma ampla compreensão do Nextflow para começar a escrever seus próprios pipelines. Esperamos que goste do curso! Este é um documento em constante evolução - feedback é sempre bem-vindo.