Bienvenido¶
Bienvenido al taller de capacitación de Nextflow¶
Nos complace acompañarlo en el camino para escribir flujos de trabajo científicos reproducibles y escalables usando Nextflow. Esta guía complementa la documentación completa de Nextflow; si alguna vez tienes alguna duda, diríjete a los documentos que se encuentran en el siguiente enlace.
Al final de este curso debería:
- Ser competente en la escritura de scripts de Nextflow
- Conocer los conceptos básicos de Nextflow de Canales, Procesos y Operadores
- Comprender los flujos de trabajo en contenedores
- Comprender las diferentes plataformas de ejecución compatibles con Nextflow
- Conocer la comunidad y el ecosistema de Nextflow
Descripción general¶
Para que comience con Nextflow lo más rápido posible, seguiremos los siguientes pasos:
- Configurar un entorno de desarrollo para ejecutar Nextflow
- Explorar los conceptos de Nextflow utilizando algunos flujos de trabajo básicos, incluido un análisis de RNA-Seq en varios pasos
- Crear y use contenedores Docker para encapsular todas las dependencias del flujo de trabajo
- Profundizar en la sintaxis central de Nextflow, incluidos canales, procesos y operadores
- Probar escenarios de implementación en la nube y explore las capacidades de Nextflow Tower
Esto te dará una amplia comprensión de Nextflow para comenzar a escribir tus propios flujos de trabajo. ¡Esperamos que disfrutes del curso! Este es un documento en constante evolución: los comentarios siempre son bienvenidos.