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Bienvenido al taller de capacitación de Nextflow

Nos complace acompañarlo en el camino para escribir flujos de trabajo científicos reproducibles y escalables usando Nextflow. Esta guía complementa la documentación completa de Nextflow; si alguna vez tienes alguna duda, diríjete a los documentos que se encuentran en el siguiente enlace.

Al final de este curso debería:

1. Ser competente en la escritura de scripts de Nextflow
2. Conocer los conceptos básicos de Nextflow de Canales, Procesos y Operadores
3. Comprender los flujos de trabajo en contenedores
4. Comprender las diferentes plataformas de ejecución compatibles con Nextflow
5. Conocer la comunidad y el ecosistema de Nextflow

Descripción general

Para que comience con Nextflow lo más rápido posible, seguiremos los siguientes pasos:

1. Configurar un entorno de desarrollo para ejecutar Nextflow
2. Explorar los conceptos de Nextflow utilizando algunos flujos de trabajo básicos, incluido un análisis de RNA-Seq en varios pasos
3. Crear y use contenedores Docker para encapsular todas las dependencias del flujo de trabajo
4. Profundizar en la sintaxis central de Nextflow, incluidos canales, procesos y operadores
5. Probar escenarios de implementación en la nube y explore las capacidades de Nextflow Tower

Esto te dará una amplia comprensión de Nextflow para comenzar a escribir tus propios flujos de trabajo. ¡Esperamos que disfrutes del curso! Este es un documento en constante evolución: los comentarios siempre son bienvenidos.