Próximos Passos - Transcrição¶
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Notas importantes
Esta página mostra apenas a transcrição. Para instruções completas passo a passo, retorne ao material do curso.
Boas-vindas¶
Parabéns, você conseguiu. Você completou o primeiro curso de treinamento Nextflow, chamado Hello Nextflow.
Muito bem. Obrigado por persistir e nós realmente apreciamos o tempo e esforço que você dedicou para aprender Nextflow, e esperamos muito que seja útil para o seu trabalho.
Próximos Passos¶
Para os próximos passos, fique de olho no portal de treinamento: training.nextflow.io. Estamos colocando novo material de curso lá o tempo todo e também atualizando. Então você pode encontrar treinamento mais avançado, ou treinamento específico para uma área de pesquisa na qual você está interessado.
Especificamente, confira a página Nextflow for Science. Esta tem uma série de cursos curtos que são independentes, e eles estendem o que você aprendeu no Hello Nextflow para casos de uso específicos.
Há um para Genômica e também um para RNA-seq. Esperamos trazer mais em breve.
Side Quests¶
Há muitas coisas que poderíamos ter falado no Hello Nextflow, que teriam sido detalhes demais. Algumas dessas coisas estamos colocando em Side Quests, que são cursos curtos sobre tópicos específicos.
Há também os cursos maiores de treinamento fundamentals e advanced, que podem incluir conteúdo que você acha interessante.
nf-core¶
Foi mencionado uma ou duas vezes neste curso, mas definitivamente confira o projeto nf-core. Há mais de cem pipelines lá para diferentes tipos de dados, então é totalmente possível que você não precise construir seu próprio pipeline.
Há também quase mil e quinhentos módulos de processo onde, se você usar as ferramentas de desenvolvimento nf-core, pode criar um pipeline e importar esses módulos em questão de segundos.
Seqera Platform¶
Por último, uma propaganda rápida para Seqera Platform. Esta é sem dúvida a melhor maneira de executar Nextflow na prática, é uma plataforma baseada em nuvem, mas você conecta sua própria infraestrutura de computação, seja sua própria conta em nuvem na AWS, Google Batch, ou Azure, ou até mesmo seu próprio HPC. O nível gratuito está disponível para todos, e se você é acadêmico, pode se candidatar ao nosso programa acadêmico para acesso gratuito ao nível pro.
Seqera Platform vai além de apenas uma interface gráfica para lançar e monitorar fluxos de trabalho. Há também ferramentas adicionais como Data Studios para executar sessões interativas, e ferramentas fundamentais como Fusion, que oferece acesso mais rápido e barato aos dados na nuvem.
Suporte e eventos¶
Lembre-se, se você encontrar qualquer problema, basta ir para community.seqera.io. Nosso fórum lá é muito ativo, a comunidade Nextflow é super forte e quase sempre há pessoas à disposição prontas para ajudar, seja para treinamento ou qualquer coisa relacionada ao seu uso diário do Nextflow.
E claro, um ótimo próximo passo é participar de um de nossos eventos comunitários, seja um hackathon nf-core ou um dos eventos Nextflow Summit. Eles são muito divertidos, e seria muito bom conhecê-lo lá e conversar sobre o que você está usando o Nextflow.
Agradecimentos¶
Gostaria de dar um enorme agradecimento a todos que estiveram envolvidos na escrita deste material de treinamento. Eu estive apresentando, mas realmente todo o trabalho duro foi feito pela equipe de treinamento da Seqera. Especificamente Geraldine, que colocou uma enorme quantidade de trabalho na reescrita deste material.
Também, Marcel, Ken, Adam, John, outros da equipe de desenvolvimento científico e outros na comunidade.
Pesquisa de feedback¶
Agora que você terminou o curso, adoraríamos saber o que você achou. Em training.nextflow.io, você encontrará uma pesquisa de feedback abaixo da seção Hello Nextflow.
São apenas quatro perguntas, mas é muito importante para nós. Se nada mais, nos diz aproximadamente quantas pessoas estão fazendo o treinamento. Também nos diz se você gostou e se você tem alguma sugestão, por favor, deixe no final. Lemos cada envio.
Se você encontrar algum erro, tudo é código aberto no GitHub, então você pode criar uma issue ou fazer um pull request ou nos enviar uma mensagem no fórum. Adoraríamos ouvir o que você achou e como poderíamos melhorar. Obrigado novamente. Espero vê-lo em breve.