콘텐츠로 이동

The Hello pipeline

AI 지원 번역 - 자세히 알아보기 및 개선 제안

대부분의 교육 과정에서는 Nextflow 개념과 메커니즘을 시연하기 위해 간단한 도메인 비의존적 파이프라인을 사용합니다. Hello Nextflow 과정에서는 모든 설계 및 구현 결정을 설명하면서 이 파이프라인을 단계별로 개발하는 방법을 보여줍니다. 다른 교육에서는 이 파이프라인 또는 그 일부를 시작점으로 사용합니다.

이 페이지는 Hello Nextflow 과정 완료 시점의 파이프라인 상태를 요약합니다.

요약 설명

Hello 워크플로우는 인사말이 포함된 CSV 파일을 받아 별도의 파일에 작성하고, 각각을 대문자로 변환하고, 다시 모아서 인사말을 말하는 재미있는 캐릭터의 ASCII 그림이 포함된 단일 텍스트 파일을 출력합니다.

워크플로우 단계 (process)

네 단계는 별도의 모듈 파일에 저장된 Nextflow process(sayHello, convertToUpper, collectGreetings, cowpy)로 구현됩니다.

  1. sayHello: 각 인사말을 자체 출력 파일에 작성합니다 (예: "Hello-output.txt")
  2. convertToUpper: 각 인사말을 대문자로 변환합니다 (예: "HELLO")
  3. collectGreetings: 모든 대문자 인사말을 단일 배치 파일로 수집합니다
  4. cowpy: cowpy 도구를 사용하여 ASCII 아트를 생성합니다

다이어그램

sayHello*-output.txtconvertToUpperUPPER-*collectGreetingsCOLLECTED-trio-output.txtHELLOBONJOURHOLàHello, English, 123 Bonjour, French, 456Holà, Spanish, 789greetings.csvHELLOBONJOURHOLàUPPER-Hello-output.txtUPPER-Bonjour-output.txtUPPER-Holà-output.txtcowPycowpy-COLLECTED-trio-output.txt--batch triotrio-report.txtThere were 3 greetingsin this batch.--input_________/ HOLà \| HELLO |\ BONJOUR /--------- \ ,+*^^*+___+++_ \ ,*^^^^ ) \ _+* ^**+_ \ +^ _ _++*+_+++_, ) _+^^*+_ ( ,+*^ ^ \+_ ) { ) ( ,( ,_+--+--, ^) ^\ { (\@) } f ,( ,+-^ __*_*_ ^^\_ ^\ ) {:;-/ (_+*-+^^^^^+*+*<_ _++_)_ ) ) / ( / ( ( ,___ ^*+_+* ) < < \ U _/ ) *--< ) ^\-----++__) ) ) ) ( ) _(^)^^)) ) )\^^^^^))^*+/ / / ( / (_))_^)) ) ) ))^^^^^))^^^)__/ +^^ ( ,/ (^))^)) ) ) ))^^^^^^^))^^) _) *+__+* (_))^) ) ) ))^^^^^^))^^^^^)____*^ \ \_)^)_)) ))^^^^^^^^^^))^^^^) (_ ^\__^^^^^^^^^^^^))^^^^^^^) ^\___ ^\__^^^^^^))^^^^^^^^)\\ ^^^^^\uuu/^^\uuu/^^^^\^\^\^\^\^\^\^\ ___) >____) >___ ^\_\_\_\_\_\_\) ^^^//\\_^^//\\_^ ^(\_\_\_\) ^^^ ^^ ^^^ ^

결과

결과는 results/라는 디렉토리에 게시되며, 파이프라인의 최종 출력(기본 매개변수로 실행 시)은 대문자 인사말을 말하는 칠면조의 ASCII 아트가 포함된 일반 텍스트 파일입니다.

results/cowpy-COLLECTED-test-batch-output.txt
  _________
/ BONJOUR \
| HELLO   |
\ HOLà    /
---------
  \                                  ,+*^^*+___+++_
  \                           ,*^^^^              )
    \                       _+*                     ^**+_
    \                    +^       _ _++*+_+++_,         )
              _+^^*+_    (     ,+*^ ^          \+_        )
            {       )  (    ,(    ,_+--+--,      ^)      ^\
            { (\@)    } f   ,(  ,+-^ __*_*_  ^^\_   ^\       )
          {:;-/    (_+*-+^^^^^+*+*<_ _++_)_    )    )      /
          ( /  (    (        ,___    ^*+_+* )   <    <      \
          U _/     )    *--<  ) ^\-----++__)   )    )       )
            (      )  _(^)^^))  )  )\^^^^^))^*+/    /       /
          (      /  (_))_^)) )  )  ))^^^^^))^^^)__/     +^^
        (     ,/    (^))^))  )  ) ))^^^^^^^))^^)       _)
          *+__+*       (_))^)  ) ) ))^^^^^^))^^^^^)____*^
          \             \_)^)_)) ))^^^^^^^^^^))^^^^)
          (_             ^\__^^^^^^^^^^^^))^^^^^^^)
            ^\___            ^\__^^^^^^))^^^^^^^^)\\
                  ^^^^^\uuu/^^\uuu/^^^^\^\^\^\^\^\^\^\
                    ___) >____) >___   ^\_\_\_\_\_\_\)
                    ^^^//\\_^^//\\_^       ^(\_\_\_\)
                      ^^^ ^^ ^^^ ^

파이프라인이 포함된 과정에 따라 세부 사항에서 약간의 차이가 있을 수 있습니다.

Seqera

Seqera