로컬 설치¶

어떠한 이유로든 GitHub Codespaces 세션을 사용할 수 없는 경우, 모든 환경을 로컬에 설치하여 사용할수 있습니다.

로컬 머신의 운영체제나 설정에 따라 요구 사항이 다를수 있습니다.

요구 사항¶

Nextflow는 POSIX 호환 시스템(Linux, macOS, Windows Subsystem for Linux 등)에서 사용 가능합니다.

필수 구성 요소

선택 구성 요소

Singularity 2.5.x (이상)
Conda 4.5 (이상)
Graphviz
AWS CLI
사전에 설정된 AWS Batch 작업 실행 환경

Nextflow 다운로드¶

터미널에서 다음 명령어를 실행하세요:

wget -qO- https://get.nextflow.io | bash

또는 curl 명령어를 사용할수 있습니다:

curl -s https://get.nextflow.io | bash

다음으로, 다운로드된 실행 파일에 실행 권한을 부여하세요:

chmod +x nextflow

마지막으로, nextflow 실행 파일이 $PATH에 포함되어 있는지 확인하세요. 실행 파일은 /usr/local/bin, /bin/ 등의 경로에 위치할 수 있습니다.

Docker¶

Docker Desktop이 컴퓨터에서 실행되고 있는지 확인하세요. 설치하지 않았다면 이 링크를 통해 다운로드할 수 있습니다.

교육 자료¶

이 링크에서 교육 자료를 확인할 수 있습니다.

자료를 다운로드하려면 다음 명령어를 실행하세요요:

git clone https://github.com/nextflow-io/training.git

이후, 터미널에서 cd 명령어를 사용해 해당 디렉토리로 이동하세요. 기본적으로 hello-nextflow 디렉토리로 이동하면 됩니다.

설치 확인¶

다음 명령어를 실행하여 nextflow가 올바르게 설치되었는지 확인합니다:

nextflow info

해당 명령어를 실행하면 현재 버전, 시스템 정보, 런타임 정보가 출력됩니다.

연습 문제

환경이 제대로 작동하는지 확인하려면 다음 명령어를 실행해 보세요:

nextflow info

실행 결과에는 다음과 같은 Nextflow 버전 및 런타임 정보가 출력됩니다 (실제 버전은 다를 수 있습니다):

Version: 23.10.1 build 5891
Created: 12-01-2024 22:01 UTC
System: Linux 6.1.75-060175-generic
Runtime: Groovy 3.0.19 on OpenJDK 64-Bit Server VM 11.0.1-internal+0-adhoc..src
Encoding: UTF-8 (UTF-8)