1. Nextflow Training¶
Nextflow 커뮤니티 교육 포털에 오신 것을 환영합니다!
이 웹사이트에는 여러 가지 다양한 교육 과정이 준비되어 있습니다. 아래로 스크롤하여 여러분에게 맞는 과정을 찾아보세요!
아래 나열된 교육 과정들은 셀프 서비스 리소스로 활용할 수 있도록 설계되었으며, 언제든지 혼자서 학습을 진행할 수 있습니다 (자세한 내용은 Environment Setup을 참고하세요). 하지만 그룹 교육 행사에 참여하면 더욱 효과적으로 학습할 수 있습니다.
- nf-core 커뮤니티에서 정기적으로 무료 온라인 행사를 진행합니다. 자세한 내용은 nf-core 행사 페이지를 확인하세요.
- Nextflow를 개발한 회사인 Seqera에서는 다양한 교육 행사를 운영하고 있습니다. Seqera 행사 페이지를 방문하여 'Seqera Sessions' 및 'Nextflow Summit'을 확인해보세요.
- 저희 커뮤니티 팀은 제3자 기관이 주최하는 교육도 정기적으로 진행하고 있습니다. 해당 교육은 일반적으로 주최 측에서 공지 및 신청을 관리합니다.
준비가 되셨다면, 이 페이지나 선택한 과정의 인덱스 페이지에서 'Open in GitHub Codespaces' 버튼을 클릭하세요. 웹 기반의 교육 환경이 열립니다 (GitHub 무료 계정 필요).
1.1 교육 환경 설정¶
환경 설정
처음 환경을 설정해보세요.
모든 교육 과정에서 사용할 수 있도록 학습 환경을 설정하는 방법에 대한 안내입니다. GitHub Codespaces에 대한 기본 소개와 로컬 컴퓨터에서 직접 작업할 수 있는 대체 설치 방법도 포함되어 있습니다.
1.2 Nextflow 입문자를 위한 과정¶
이 과정들은 Nextflow를 완전히 처음 접하는 분들을 위한 기초 수업으로, 특정 분야의 전문 지식 없이도 학습할 수 있도록 구성되어 있습니다. 각 과정은 단계별로 실력을 쌓을 수 있도록 여러 개의 교육 모듈로 이루어져 있습니다.
Hello Nextflow
Nextflow로 파이프라인 개발 배우기
동영상 자료 제공
이 과정은 자신만의 파이프라인을 개발하고자 하는 입문자를 위한 교육입니다. Nextflow 언어의 핵심 구성 요소들을 충분히 상세하게 다루며, 단순하지만 완전한 기능을 갖춘 파이프라인을 개발할 수 있도록 도와줍니다. 또한 파이프라인 설계, 개발, 설정에 필요한 주요 개념들도 함께 다룹니다.
곧 출시 예정: "Nextflow Run" — Nextflow 파이프라인 실행 배우기 (코드 개발 없이 실행만 다룸)
1.3 과학 분야를 위한 Nextflow¶
이 과정들은 위의 'Hello Nextflow'에서 소개한 개념과 구성 요소들을 실제 과학 분야의 활용 사례에 적용하는 방법을 보여줍니다. 각 과정은 단계적으로 실력을 쌓아갈 수 있도록 여러 개의 교육 모듈로 구성되어 있습니다.
유전체학을 위한 Nextflow
Nextflow로 유전체학 파이프라인 개발 배우기
이 과정은 자신만의 유전체학 파이프라인을 개발하고자 하는 연구자를 위한 교육입니다. 변이 분석(variant calling) 사례를 통해 간단하면서도 기능적인 유전체학 파이프라인을 개발하는 방법을 보여줍니다.
RNAseq를 위한 Nextflow
Nextflow로 RNAseq 데이터 처리 파이프라인 개발 배우기
이 과정은 자신만의 RNAseq 파이프라인을 개발하고자 하는 연구자를 위한 교육입니다. 벌크 RNAseq 처리 사례를 통해 간단하면서도 기능적인 RNAseq 파이프라인을 개발하는 방법을 소개합니다.
어떤 분야나 사용 사례가 추가되었으면 하는지 커뮤니티 포럼의 교육 섹션에 글을 남겨 알려주세요.
1.4 Nextflow 심화 교육¶
이 과정들은 Nextflow의 기능을 더 자세히, 또는 더 고급 수준에서 활용하는 방법을 보여줍니다. 각 과정은 관련 주제에 대한 실력을 더욱 깊이 있게 다듬을 수 있도록 하나 이상의 교육 모듈로 구성되어 있습니다
사이드 퀘스트
다양한 주제를 다루는 교육 모듈
이 과정은 Nextflow 개발자가 기술의 폭을 넓히거나 깊이를 더하고자 할 때 적합합니다. 모듈은 순서대로 제공되지만, 학습자는 자유롭게 원하는 주제부터 선택하여 학습할 수 있습니다. ‘Hello Nextflow’ 과정을 넘어서는 내용이 필요한 경우, 각 모듈 개요에 그에 대한 의존성이 명시되어 있습니다.
기초 교육
Nextflow의 모든 기능을 아우르는 포괄적인 교육 자료
이 기초 교육 자료는 Nextflow의 전반적인 내용을 다루며, 복잡한 워크플로우를 구축하려는 분들을 위한 참고 자료로 활용될 수 있습니다.
고급 교육
Nextflow 마스터를 위한 고급 교육 자료
Nextflow 언어와 런타임의 고급 기능을 탐색하며, 이를 통해 데이터 집약적인 워크플로우를 효율적이고 확장 가능하게 작성하는 방법을 배울 수 있습니다.
1.5 기타 / 실험적 과정¶
이 교육 과정들은 현재 적극적으로 유지되거나 진행되지 않고 있으며, 향후 다른 용도로 재구성되거나 삭제될 수 있습니다. 해당 자료들은 교육 환경에서는 제공되지 않으며, GitHub 저장소에서 직접 다운로드하여 로컬에서 사용할 수 있습니다.
- nf-customize — nf-core 파이프라인 설정 (문서 / 코드)
- nf-develop — nf-core 템플릿으로 파이프라인 개발 (문서 / 코드)
- troubleshoot — 문제 해결 연습 (문서 / 코드)
- hands-on (rnaseq) — 벌크 RNAseq 파이프라인 개발 (사용 중단됨) (문서 / 코드)
1.6 자료 모음¶
유용한 참고 링크들을 빠르게 확인해보세요:
| 참고 자료 | 커뮤니티 |
|---|---|
| Nextflow 문서 | Nextflow Slack |
| Nextflow 홈페이지 | nf-core |
| Seqera | Seqera 커뮤니티 포럼 |
어디서부터 시작할지 모르겠다면 도움 받기 페이지를 참고하세요.
1.7 크레딧 및 기여¶
이 교육 자료는 Seqera에서 개발 및 유지 관리하고 있으며, 커뮤니티의 이익을 위해 오픈소스 라이선스(CC BY-NC-ND) 하에 배포됩니다. 라이선스 조건에 따라 자유롭게 재사용하실 수 있습니다. 교육을 진행하는 강사분이라면, 사용 경험과 개선점을 저희에게 알려주시면 감사하겠습니다.
커뮤니티의 수정 및 개선 제안을 언제든지 환영합니다. 각 페이지 오른쪽 상단의 아이콘을 클릭하면 GitHub에서 Pull Request를 통해 제안할 수 있습니다.
